馬英九順利連任，國民黨繼續執政，但並沒有進入北京期待的兩岸政治路線圖。北京企圖以增加政治互信來開啟兩岸政治協商的途徑，但台灣保守以對。像吳敦義在博鰲論壇提出兩岸新十六字方針：「求同存異，兩岸和平，講信修睦，民生優先。」從大陸的角度視之，認為這十六字過度保守，沒有開創性，兩岸還是在原來的軌道上進行，沒有快速前進，也沒有後退。
吳敦義提出的「求同存異」是兩岸共同的主張，「兩岸和平」則是共同努力的目標，並無太大新意；至於「民生優先」，則讓兩岸議題又回歸到單純的經濟議題。熱熱鬧鬧的「李吳會」下來，正是外行人看熱鬧，內行人看門道，馬英九政府隔擋了北京刻意向前的兩岸路線，與大陸方面期待看到「由經到政」的突破點有落差。吳敦義提出《禮運‧大同篇》的「講信修睦」，透露了台灣與大陸認知的差距，就算是兄弟，無信不立，且以信修好。
目前，很多台灣人一提起「和平協議」，就覺得是不戰而降，其實，大陸對和平協議也有困惑。有人認為，和平協議會讓兩岸分立的狀況永久化，未必有利兩岸統一，故兩岸先要凝聚內部共識，才能跨出和平協議的步伐。
現在，兩岸要進入政治議題的協商，前提就是政治定位的問題。吳伯雄提出了「兩岸同屬一中」及「一國兩區」，並補充了「九二共識」的內涵。兩岸應讓「一中」有模糊空間，此乃「九二共識」的價值。北京若執意進入政治議題的協商，必先承認「一中可以各表」，其次承認兩岸定位和「中華民國」在國際上存在的事實，並回應台灣希望擴大國際參與，尋求國際空間的問題，如此才有開啟政治談判的條件。