一般人認為中藥的副作用較西藥少，港人對於中醫藥的接受度也愈來愈高，以中西醫結合的方式治療疾病，也趨普遍，如果使用得當可增強療效，並能減低藥物的毒性副作用，但因中藥的化學成分和藥理作用十分複雜，若因不了解各藥物成分性質而配合不當，輕則降低藥效，重則引起毒性反應，絕對不可忽視。一般而言，為了避免中藥與西藥在腸胃內產生交互作用，在服用一種藥物後，間隔兩小時再服用另一種是比較安全的做法。
有些中藥是不能與西藥一起服用，中西藥合用有着物理、化學和藥理性質等各方面的相互作用，例如某些中藥成分進入胃腸後，可能會改變腸胃中酸鹼度，與合用的西藥發生化學反應，形成無活性的物質或影響某些西藥的吸收而影響療效。
另一例子是藥酒內含有的乙醇具有一定的中樞抑制、擴張血管、誘導肝酵素等作用。抗結核病的西藥與含乙醇的中藥藥酒如虎骨酒、國公酒同服，會加速前者在肝臟內的代謝分解，產生有毒物質，使此類藥物本身所具有的肝毒性加重。含乙醇的各類藥酒如果與鎮靜藥苯巴比妥同服，會容易抑制中樞神經系統，導致昏睡等副作用。
有些中藥會導致西藥在血中的濃度降低或升高，造成療效不佳或是增強西藥的毒性與副作用。例如：銀杏抽取物與抗凝血藥品一起使用時會增加病人出血的危險。因此，我們要充分告知中醫師或是西醫有關自己病歷及正在服用的中藥、西藥等，由專業人士判斷中西藥是否可以併服。
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