馬英九表示今後沒有連任的壓力只有歷史評價的壓力，引起了各界的揣測，究竟馬英九想追求的歷史評價是甚麼？政治、經濟或國際空間？兩岸的成就？紐約大學教授孔傑榮也是馬英九的老師，就為此指點江山，要馬英九在兩岸和平發展上尋求突破，將來或可獲得諾貝爾和平獎，於歷史留名，但是這一說法引起台灣內部的反彈。
大部分民意認為台灣在兩岸關係上不能走得太快。馬英九推動「九二共識」，成了兩岸關係向前行的萬靈丹，不過這是基於馬英九強調「九二共識」為經濟議題，可加強兩岸的經濟關係，但事實並非如此，「九二共識」可說是一個共識各自表述，北京着重於「一中」是政治議題，而馬政府着重「各表」乃是經濟議題。兩岸關係再發展下去，要面臨的就是政治議題，「九二共識」很難再政經切割分離，這是馬英九下任將面臨的問題，馬如何處理就涉及歷史定位的問題。
國民黨走過威權體制時代，國庫通黨庫，現被要求各政黨的黨產歸零，以有起點式的平等競爭，但國民黨雖稱黨產信託，每年卻坐收三、四十億的利息，有錢好辦事，對國民黨打起選戰有極大助益，但總被在野批為缺失公平正義，黨產的處理應是不可再迴避之事。馬的歷史評價應是內造的改革，國民黨的改造重生，黨內民主的確定，程序正義的維持，讓國民黨徹底擺脫黑金派系，國民黨有新的風貌才能在台灣政壇上永續經營與發展。
台灣的司法公信力不張為人民詬病，司法改革已是人民至盼，建立獨立有執行公權力的反貪機構徹底改造政府的體質，這才是馬英九的歷史評價與定位的關鍵。