分區混亂 兩個機構大致以立法會五大選區和十八個區議會選區進行劃分，「東邊」的信息共融基金會負責北區、大埔、沙田、西貢、黃大仙、觀塘、九龍城和港島東區，「西邊」的網上學習資源中心負責元朗、屯門、葵青、荃灣、離島、深水埗、油尖旺、中西區、灣仔和南區，即港島區被強行一分為二，原屬九龍西的九龍城則被劃入「東邊」，若受惠家庭跨區搬家，兩個機構便要轉介個案再行跟進。
浪費公帑 計劃原意是透過集體招標降低電腦硬件及上網服務費用，分區執行自然令費用相對提高；兩間機構各自物色供應商提供電腦硬件及上網服務，價錢、型號及功能亦可能出現差異。
執行細節各異 信息共融基金會從社區招募義工提供技術支援及培訓輔導服務，較易出現濫用受助家庭資料作其他用途問題；網上學習資源中心則主要透過學校及非政府組織提供相關服務。