蕭萬長引退，吳敦義成為馬英九競逐二○一二大位的副手似已成定局，承擔着國民黨是否延續政權的重任。
總統大選戰鼓擂動，依藍營內部的民調，「馬吳配」只領先對手蔡英文五至六個百分點，約七十到八十萬票，選情相當緊繃。但「馬吳配」有互補效用，吳敦義當過高雄市長，除他的本省籍外，尚能掌握南部的政治生態，尤其他現為行政院長，如果他帶職參選有豐厚的行政資源，而且黨籍立委願意幫忙抬轎，可營造府院黨大團結氣勢。
國民黨內部評估，要取得總統大選的優勢，勢必要與立委聯合競選，相互拉抬，動員地方樁腳，吳揆帶職參與有其優勢。
從國民黨角度來探討，據了解內情人士表示，吳敦義今年初以來宣布多項利多政策，枱面上是宣揚閣揆政績，企圖收買人心肯定政府政策，私下則是動作頻頻，積極營造閣揆參選的有利態勢。
但從在野民進黨的檢視中，認為執政黨應顧及行政中立的原則，一旦吳敦義成為副總統人選，就必須即刻辭去行政院長職務，否則整個國家資源恐怕都會被拿去綁樁。
依國民黨的盤算，總統與立委合併選舉，亦可利用馬英九的聲勢名望拉抬立委選舉，可惜馬英九施政滿意度始終無法提升，綠色選民固然不支持，連藍色選民亦不滿意，面對連任之戰，勢必動用行政資源輔選。面對民進黨的杯葛，未來吳敦義投入選戰，恐有一番朝野爭議。
台灣的民主進程在政黨輪替中，各政黨不斷地檢討改進，讓民主制度更加完善，政黨若僅以當選矢志而忽略選舉程序正義，當然會引來攻擊與不滿，恐贏了選舉卻失了民心。