內地食物安全問題，深層次因素是為了賺錢而不擇手段，缺乏道德，但也有些人認為，食物加添化學劑並無問題，而是增加食物的優質，例如瘦肉精可減肥肉增瘦肉，三聚氰胺可低成本產生蛋白質，豆芽加無根豆芽調節劑長出的豆芽又長又漂亮……
這些人以為，化學作用等同科學，這是把科學應用於食物，效果更佳，節省成本，為甚麼不用？這與政府鼓勵農民種糧食等農作物，用大量化肥、農藥，乃至基因改造的品種，以及在禽畜方面，用抗生素等等，有甚麼分別？
於是，食物安全問題便有一個制度性因素。食物是否等同工業製品，可用化學因素替代天然因素？例如人造皮替代天然動物皮毛，塑膠替代天然竹木等。若果政府是將之相類於工業產品，用工業化的方法推動農牧漁的食材增產，在食物鏈的上游部分已經存在工業污染因素，在下游環節，與奸商黑戶們用化學手段把食物成品工業化地加工，本質上分別不大。
化肥、農藥、基因改造的物種等，都構成對人類和自然環境的污染，政府還大力推動。小商小戶用小手段弄虛作假，對人類健康當然構成威脅，可是危害的程度，可能不及政府大政策的污染帶來的危害更大和更深遠，例如基因改造動植物，可以把原來的天然品種滅絕，破壞自然的食物鏈和平衡。
除了加強監管、宣揚道德外，從根本解決問題的方法是少吃、粗吃，從消費的環節來抑制食物的工業化——污染的基本根源。