民進黨過去基於意識形態操作台獨，故延續李登輝的「戒急用忍」，以及陳水扁的「積極管理」主導兩岸政策，對馬英九快速大幅度開放兩岸政策充滿疑慮，認為是向中國傾斜，出賣台灣主權。因之全力排斥馬英九的兩岸政策，尤其是簽署ECFA，民進黨詮釋為台灣主權不保及農業受衝擊，台灣勞工將失業，在如此的宣傳操作下，引起了老百姓的憂慮。

馬英九面對此次選舉的失利，他表示兩岸政策還是受到大多數人民的支持，但是願意聆聽民眾的意見，對未來的兩岸政策作必要的調整與改進，以謙虛之心來檢討。可見今後兩岸政策不會像過去一年多來的大步向前進，必在檢討與調整下放緩腳步。

馬英九上台後，「馬上好」的承諾跳票，他求好心切快速開放兩岸政策，彌補過去八年的停滯不前，開放的步伐與幅度均是前所未有，也委實引起台灣部分民眾的憂心，包括許多大陸台商也認為馬英九的兩岸政策走得太快，失去了主動性與安全網。

例如最近將公布陸資可赴台買股票，以陸資規模的龐大，引發了對陸資可能操控台灣股市的憂慮，ECFA的簽署更擔心對勞工不利。

馬英九現要面對的是明年五個都會區的選舉，必會調整其兩岸政策，不讓民進黨再攻擊他親中賣台。北京原本期待兩岸可盡快進入政治議題的探討，經此次戰役，政治議題將是最敏感的議題而被馬英九擱置。其實，北京也不應強人所難，對政治議題步步進逼，否則在大環境未成熟之前，逼馬英九談政治議題，無非讓馬政府自殺，兩岸政策及兩岸關係將面臨倒退。