原來，台灣因為已退出聯合國，而且不是《聯合國海洋法公約》的締約國，所以沒有申請大陸架的主體資格，但是，台灣外交部並沒有置身事外、袖手旁觀，當時就發表聲明，台灣不受這個最後期限的規限，中華民國保有對於東海、台灣東部海域及南海海域主張超過二百海里大陸架的外部界限。

事實最為重要的是，在二○○四年，台灣就啟動了大陸架調查工作，參與調查的都是來自台灣各間大學的三十多位學者。他們租用了三艘科學勘測船，五年來共在海上工作了十五個月，縱然經費不足、海洋工作環境惡劣，亦都沒有使他們的調查停下來。尤其是在釣魚島附近海域調查，探測水深、海底地貌，藉以搞清大陸架的走勢發展時，不斷遭到日本海上保安廳的干擾，但是，他們並沒有退縮，護土有功。

據悉，台灣方面基本上摸清了相關海域大陸架的情形，而且是在五月十三日前就整理完畢。因此，還引來綠色陣營人士攻擊調查人員將資料提供給北京，方便大陸向聯合國提交自己的申請。其實，這種攻擊完全是捕風捉影，子虛烏有。參與調查的台灣學者強調自己是科學家，只做好科學家應做的事情。

亞洲的海洋專家指出，與日韓相較，中國兩岸對大陸架的調查研究都相對落後。顯然，如果兩岸真的可以聯手，當可迎頭趕上，問題是兩岸聯手並不易。