馬英九上台後，不同於李登輝和陳水扁，不再模糊釣魚島主權誰屬，而明確堅定釣魚島主權我屬，與北京的態度一致，將來有共同捍衞該島主權的可能。

兩岸的結盟讓日本不再有操弄的空間，日本擔憂失去了東亞的優勢，因之日本防衞省正考慮在東海鄰近釣魚島的與那國島部署軍隊，將日本軍隊目前駐守的位置向南延伸。日本政府這項考量，乃以捍衞其南疆的領土主權與國家安全，此舉應有戰略的宣示性動作，故引發了周邊國家的嚴重關切。

日本與中國本來就是東亞的競爭者，而目前又存在東海油田及釣魚島群島主權誰屬的紛爭，中日間的問題就浮上了水面，更何況與那國島也在中國導彈及空軍的攻擊範圍內，日本在與那國島部署軍隊乃是抗衡中國的軍事壓力。

此外，中國的潛艇常神出鬼沒，來無影去無蹤，不僅讓日本，也讓美國在東亞感受到中國軍力的突擊。日本防衞省發言人表示，正在研擬將這一部署列入年底修訂的防衞大綱中。

儘管日本還未最終拍板，周邊的鄰國已相繼表示關切，中國外交部就表示希望日方的舉動有利於地區和平與穩定。在國土內調動武裝部隊是國家主權的彰顯，看起來似乎是日本家務事，但中國也深知項莊舞劍之意。各方期盼北京應透過外交的手段向日本官方表明立場，進一步向美國表態，不希望東亞地區陷入軍事競賽。美日軍事同盟的主要對手乃是中國，雖然中國極力創造和諧世界，但美日卻不敢掉以輕心，日軍南調實不利東海的和平與穩定。