滬港通推出將近四個月，南向北向均只用上很少額度，與市場預期有一定差距，卻無阻深港通有望上半年獲批、下半年推出，難免予人急於求成及過於倉卒之感。而且，如果滬港通及深港通要各自設置一套交易機制，更有疊床架屋的感覺，對券商及投資者均會造成不便。因此，應把滬深兩市與港股互通進行整合，以一條通道貫通中港兩地股市，將更具成本效益，更便利投資者。
目前滬、深兩市都設有主板，上海股市以國企為主，深圳股市側重民企，且近年做得較出色是中小板及創業板，成功吸引不少科技企業上市。換言之，滬、深股市存在直接競爭，而隨着市場進一步開放，競爭加劇更是必然。站在內地資本市場發展的角度，整合滬、深股市，優化資源並理順關係，再與港股互通，是切合實際的做法。
深圳與香港地理位置鄰近，經濟關係更密切，但中央選擇先推滬港通，相信是出於監管考慮，特別是深市以民企、中小企及創業板為主，散戶亂炒及大戶操控的陰影揮之不去，且成交未及大型國企雲集的滬股。難怪深圳先於上海開始研究與港股互通，卻失落頭籌。
滬、深兩市本身存在差異，兩市與港股性質亦不同，除了交易及結算系統等硬件的技術問題，還有跨境監管、訊息披露、稅制、投資者保障、資金流管控等方面，同樣不能有閃失。滬港通經過大半年籌備，如今兩地投資者仍在熟習當中，讓其繼續運行一段時間，檢討機制並進行完善，在此基礎上再接通深股，提升與港股互通機制，才是按部就班做法。
若然為應付地方政府角力，又或券商行業爭取交投體現系統投資回報，急於一時在「滬港通」之上再硬套「深港通」，不但機制繁複兼容易混淆，市場操作亦存在一定風險，投資者也會無所適從。A股既然是一個整體，在滬港通試點基礎上，積極研究滬深兩市兼融之道，再擴大為面向國際投資者的互通平台，肯定更符合國情需要。
中、港兩地股市發展有一定差距是事實，如果能成就一個分別融合以傳統大盤股為主，另一個以中小企、民企及科技創新企業為主，以及一個以國際化企業為主的滬深港三地市場，這個超級中國股市將發揮最大的集資功能及影響力，才是中國資本市場發展的最終目標。因此，在研究深港通之時，不妨把目光放高一個層次來考慮。