早期的居屋，並沒有折扣率，而是以禁售期作招徠。如第一期的居屋火炭穗禾苑，不設折扣率，而設十年禁售期。於一九八二年起推出的居屋，方以市值折扣率方式出售，即合資格人士如綠表及白表申請人，可以市值折扣價購買居屋，然後設定五年的限制轉讓期。期內，如業主出售單位，須首先申請將單位回售予房委會，並在房委會拒絕該回售申請後，業主才可於繳付補價後在公開市場出售單位。若限制轉售期過後，業主就可通過補價程序於自由市場買賣，或於居屋第二市場買賣。居屋第二市場是指居屋業主未經過補地價程序，只能出售給綠表或白表人士。

補價數額 房委評估

至於補地價的程序，則業主首先要向房委會申請評估補價金額。計算方法為補價相等於將原來樓價的折扣，化為現值計算。例如房委或房協一手售出價為140萬元，折扣率為七折，即購入時的十足市值為200萬元，到禁售期過後，單位市值已升至210萬元，補價金額即為現時市值的三成，即63萬元。由於申請補價並不需要轉售才能申請，故若單位市值愈低，補價金額愈小，故現金充裕的居屋業主，趁淡市時或樓價下跌時先補地價較划算。當補價過後，房委會會發出解除轉讓限制證明書，業主才可將單位於自由市場上放售。

不過，居屋業主要留意，若未經補價程序，而單位仍在五年轉讓限制期內，業主自行簽訂買賣協議、出售或出租單位，甚至按揭的話，即屬違反房屋條例（第283章）第27A條規定，可被罰款50萬元及監禁一年，並且所有買賣協議均屬無效。

若單位五年轉讓限制期已屆滿，則業主可在申請補價前訂立單位的買賣協議，但在出售、出租或轉讓單位前繳付補價。另外，業主亦可以通過按揭方式去繳付地價，業主可與律師及銀行安排，在解除轉讓限制證明書生效當日簽訂按揭契約。如未繳付補價或未經房屋署署長許可便將單位按揭，即屬違反房屋條例，按揭契約亦會無效。