馬英九推行的兩岸政策被綠營質疑「犧牲主權」，馬英九發表文告時再次表明，台灣的未來由二千三百萬台灣民眾決定。而在兩岸關係上，馬英九則拋出「百年和平」概念，強調兩岸間不應該是政權之爭，不應該是統獨之爭，應該努力在自由民主、人權法治等核心價值，彼此激勵，相互提升。也只有台海和平，兩岸才有進一步發展的可能。
民進黨堅持台灣優先
蔡英文發表的元旦文告則稱，民進黨與國民黨最大的不同在於，民進黨信仰「土地與人民」，堅持台灣優先。她又指出，民進黨今年要提出一個有別於目前國民黨的新經濟思維，來抵擋貧富差距的趨勢繼續在社會裏惡化。