總統李明博召開二次緊急會議，但沒有譴責北韓，似乎有意避免危機升級。南韓官員昨日向媒體稱：「在軍艦沉沒的海域沒有發現北韓軍隊存在的迹象。」南韓媒體亦漸漸淡化事件初期對北韓的指控，改為質疑是南韓海軍的自身問題，認為「北韓不會如此鹵莽地進行挑釁」。
事件亦令南韓的國防力量受到質疑。該國近年來躍躍欲試，希望建構「大洋海軍」，躋身國際舞台，派兵執行維和任務。有報道便認為，南韓的國防支出不夠，指出南韓國內生產總值（GDP）比北韓高出四十倍，國防開支理應可多於北韓整體GDP。南韓海軍亦承認，在天安艦爆炸沉沒之際，附近一艘南韓軍艦誤把飛鳥當成不明船隻射擊。