2009年8月，《公益時報》引述知情人士消息指，農夫山泉並沒有依「一瓶水，一分錢」的廣告所言捐款，涉嫌欺騙消費者。

2008年4月，一名網友在多個論壇發帖稱曾「喝農夫山泉喝出安全套」，令民眾對農夫山泉產品信心大減。

2008年7月，農夫山泉還被指刻意抹黑競爭對手用自來水做礦泉水，事件引起極大爭議。事件令農夫山泉迅速上升，打入飲用水市場前三甲。