被質疑官商勾結

二○○五年，台北市議員李慶元曾到南勢溪勘察，稱看到不少溫泉業者的污水管，在溪邊排出很多攙有白色雜質的污水，引來大批魚群爭食，估計這些應該是人類的皮屑，惡心至極。部分餐飲業者與家庭也把糞水、洗碗水、剩菜殘羹長期排放入溪中。另外，南勢溪邊有不少民眾免費浸溫泉，污染溪水。

李慶元質疑，中央與地方單位遲遲不解決水污染問題，疑有官商勾結，要求中央及地方相關單位嚴格取締污水排放問題，所有烏來溫泉區及沿溪住戶的各種污水，均須排入污水下水道，經符合標準的污水處理後，再以共同管道排放到淨水廠取水口的下游，事件經媒體廣泛報道，相關官員當年曾辯稱無法規監管。

在同年十二月，環保署公告《水污染防治事業分類及定義》，把溫泉業列為水污染防治法規範範圍，但是迄今仍未能改善污染問題。