昔日東方港大研生物技術 追蹤打針後免疫反應
【本報訊】香港大學工程學院電機電子工程系教授謝堅文領導的跨學科研究團隊，開發了一種能處理龐大數據並作出精準推算的新穎計算工具「VIA新軌迹推理算法」，有內地及海外的科研團隊已將之應用於新冠病毒研究，追蹤人體接種疫苗後，對不同病毒的免疫反應。研究成果已於學術期刊《自然通訊》（Nature Communications）發表。
可處理大量數據推敲規律
團隊開發的名為VIA的新軌迹推理算法，利用一種新穎的「無監督式」機器學習方法，模擬人類的思維過程，像人腦般發掘數據背後的邏輯規律作推敲。在引導VIA機器學習過程當中，團隊廣泛收集包括單細胞蛋白質組學、基因相關和其他生物訊息的組學數據，對各個重要的生物過程作全面分析研究。
電機電子工程系學生Shobana Stassen說，需要處理的細胞數量以百萬計，VIA依然取得良好效果。VIA處理數據規模龐大、精準度高，目前未有任何運算方法能及，例如VIA能推算出在骨髓造血過程中，細胞狀態微妙複雜的轉變，從而可預測一些像血癌等的病變及病情發展，為治療方案提供病理基礎。
團隊使用新開發的光學顯微鏡系統，能以比現時任何典型顯微鏡快至少100倍的速度，生成大量高解像度單細胞圖像數據。團隊利用VIA成功揭示了細胞周期進程中細胞質量的細微變化及質量含量分布。
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