近年不斷有邨巴承辦商宣布減少服務班次甚至停辦,有邨巴組織將矛頭直指運輸署,認為該署不斷因「瑣碎事情」 檢控邨巴公司,令其難以經營,質疑政府不斷為專利巴士鋪路,在車站附近加開特快線,目的為趕絕合法的居民巴士承辦商。
「起點站一個起兩個止,再多運輸署唔會批。」新界西北邨巴大聯盟主席文海迪解釋,運輸署將邨巴服務定義為點對點的服務,原則上只有一個車站供上、落客使用,但實際情況是「一條邨一個站」遠遠不夠客源以營運一條巴士線。
除了站頭問題致客源不足,文又指運輸署不斷檢控邨巴公司違規經營,執法過嚴,例如班次停站只過兩個門牌和司機為避開塞車兜路亦會被檢控,輕則取消巴士牌照一個月,最重則永久取消牌照,「今年已經有十條邨巴線做唔住被迫取消服務,估計將來會由專利巴士服務頂上。」