約八成夏季發生
整體上，約八成EV71個案發生於夏季，介乎四月至八月。防護中心將二百卅九宗病例，分為嚴重併發症個案及沒有嚴重併發症兩組作分析。結果發現，前者較多為兒童在內地病發，然後再來港治療。出乎意料，沒有嚴重併發症的一組病人，反而較多人本身有長期病患。
防護中心又分析，在一○年七月至一二年六月的兩年間共廿六名兒童感染其他腸病毒（非EV71）嚴重個案，兩名患者死亡。其中十九名兒童不足一歲，四人介乎一至五歲，其餘三人為五至十二歲。發病情況與EV71類似，七成個案於六月至八月期間發生。調查發現，主要致病原為柯薩奇病毒B，佔42%，其次為柯薩奇病毒A及伊科病毒。