今次人大政府工作報告整體平實，是沿襲這幾年的政策和「十二五」規劃的方向提出今年的工作，循序漸進。但有關港澳的論述，卻提出全新的提法和要求，背後的原因可能是回歸以來香港的管治出了問題，中央政府不得不把對港政策（連帶對澳門政策）改轅易轍。
新的政策方向有三：港澳要發揮在中國整體發展中的獨特作用。也即是說，港澳不能獨善其身，或獨惡其治，不但在自治的框架下把本地治理好，還要與國家的整體發展掛鈎，發揮獨特的作用。後者顯然是中央政府反對香港近年的「內地化」趨向。
內地（包括全國各地）與港澳的合作要機制化。機制化則是長期化、制度化，不是一事一議的做法。港澳要對國家發展有作用、有貢獻，需要與內地建立制度化的關係，在一些政策範疇有特定的渠道或常設的平台，讓港澳發揮獨特的作用。
推動粵港澳的區域合作。中央政府認許現時的粵港澳合作框架協議，而且要將之深化、落實，中央政府作為後盾，作為督促者，粵港澳三方便要積極進行實質的合作。
這三點與過往空泛地談「港人治港、一國兩制」、實際把港澳撇在內地以外有質的變化。港澳辦的政治功能一直以來是保證港澳與內地的分隔，不是合作、不是融合，這種分隔主義是錯解港澳回歸意義，割裂港澳在回歸後與內地共生共存的關係。特別是今天香港的問題，大部分源自此分隔主義，今次政府工作報告的提法，便是撥亂反正。