自從視窗內置了防毒軟件後，部分用戶索性不安裝防毒軟件，倚靠視窗本身的防毒功能。然而，據多個不同的防毒軟件評測報告指出，視窗內建的防毒軟件性能較弱，用戶宜自行安裝獨立的防毒軟件，會令電腦有更佳的保護。
要比較各防毒軟件的優劣，可以參考AV-Comparatives或Virus Bulletin這兩大防毒軟件評測報告。該報告每年更新，比較各款防毒軟件的性能。其中在一些實驗室測試中，研究人員會以數千種不同的電腦病毒樣本，嘗試攻擊電腦，看看不同品牌的防毒軟件能否把電腦病毒逐一攔截。研究發現，大部分知名品牌的防毒軟件如Avira、Avast、F-secure或Kaspersky等，無論是收費或免費版本，皆可以攔截96%至99%的電腦病毒。唯獨是視窗內建的防毒軟件性能稍弱，只能攔截約90%的電腦病毒，保護未夠全面。
當然，能夠攔截9成的電腦病毒，總比沒有安裝防毒軟件好。而且測試始終是一個模擬環境，在現實中，用戶很少會同時面對數千種不同病毒。現在視窗8一出廠已經內建防毒軟件，其實是一大進步。若用戶希望有更好的保護，可以自行安裝一個正式的防毒軟件，付費或免費皆可，電腦將更安全。
目前視窗8內建的防毒軟件叫Windows Defender，而視窗7、Vista或XP可以自行安裝微軟的Security Essentials，兩者都是免費。不過，既然其他防毒軟件有更佳的防毒能力，對XP的支援期限又較長，當然更值得使用。
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