熊先軍表示，全國逾九萬三千人次的確診和疑似患者繳交醫保，總費用為十億四千萬元（約十一億五千萬港元），其中有患者多次入院治療。目前各地醫療機構預先支付醫藥費資金壓力大，熊先軍指截至本月十九日，醫保部門已預付專項資金一百九十三億元（約二百一十四億港元），其中湖北佔三十七億（約四十一億港元）。
熊先軍強調，診療方案中的體外膜肺氧合（ECMO）對診療水平要求較高，醫療費用較為昂貴，在疫情期間，已新增該項醫療費用入醫保範圍內。若有患者並非在醫保戶籍地入院治療，會由異地醫保部門預先支付，疫情結束後再統一處理。