美日在釣魚島挑起爭端，大陸期望與台灣聯手共同維護中華領土主權，但馬英九卻予以拒絕。他在接受日本媒體報道時聲稱，台灣不會與大陸聯手跟日本交涉解決釣魚島問題。馬英九此舉，清楚表明他對中國統一進程毫無興趣，也對兩岸的軍事談判毫不熱心。
隨着美國對華圍堵加劇，日本也在釣魚島問題上頻頻發難。先是聲稱要在釣魚島駐軍，然後又稱會將該島國有化，並表示《美日安保條約》適用於釣魚島。東海局勢風高浪急，北京面臨以寡敵眾的局面。
釣魚島問題牽涉兩國三方，北京期望兩岸能形成共同抗日、兄弟聯手保釣的局面，尤其是馬英九是保釣熱血青年出身，兩年前台灣成立中華保釣協會時，馬英九還曾致送「和衷共濟」的條幅。馬英九的這些保釣歷史，讓北京看到希望，北京學者近期也不斷放風，測試兩岸共同保釣的可能性。
中國軍事科學院羅援少將日前發表文章，稱兩岸軍人應該共同捍衞「祖權」，有所作為。而中國人民大學一名副教授則認為，釣魚島問題是對馬英九的考驗。大陸軍界和學界的放風並非無的放矢，而是向馬英九提醒，在釣魚島問題上要知所輕重，要體現出「一個中國」的做法與勇氣。
但北京的期望顯然落空，馬英九近日對日本媒體大派定心丸，稱有關釣魚島的主權之爭，台灣不會和大陸聯手與日本交涉，希望台日應針對漁民的海上作業權益問題，先形成具體共識。他還表示，美日同盟是東亞和平與安定的基礎，台灣會繼續向美國購買武器，維持台美的軍事合作關係。
馬英九這番談話，不僅公開粉碎了北京對他的期望，也真實表露出他背倚美日抗衡大陸的真實心態。馬英九雖然曾是保釣青年，但當初的熱血已被現今的政治盤算所代替，在他看來，美日才是台灣的保護傘，即使出賣釣魚島的主權也在所不惜，如果大陸與美日就釣魚島開戰，反而是台灣實現獨立的良機。
馬英九上台之後，北京一直對他充滿期望，單方面對台灣作出重大讓利，不僅經濟上輸血，而且也停止了外交打壓，准許台參與一些國際組織。北京期望先經後政，通過讓利讓台灣感恩戴德，兩岸可以走上統一的道路，但現在看來，這不過是北京的一廂情願。
馬英九與大陸緩和關係，是想搭上大陸經濟騰飛的快車，讓台灣經濟步出泥潭。但他的緩和是有底線的，也就是不能衝擊美台關係，不影響台灣實質性獨立的地位。因此，他對北京期望的政治和軍事談判根本不感興趣，能拖則拖，能賴則賴，但北京似乎對他充滿迷思，撞破南牆也不回頭。