特區政府在與港鐵簽訂協議時，突然把廣深港高鐵的預期載客量大幅下調至每日八點一萬人次，比原來的十萬以上人次大減。政府的說法是以保守數字來估算高鐵營運與財務，但為甚麼採取保守的數字？這個數字又是從何而來？
載客量的估算應有一定的科學根據，不應由政府或港鐵從管理和財務的角度來制訂。本來最佳的參考數據方法是把近年香港鐵路每日過境人次作為準則，但不是所有過境人數，而是考慮到新界過境可直通羅湖過境再轉乘動力車組更為方便，只看九龍塘站以南的過境人數，包括紅磡的直通車和東鐵運量，看近年的增減趨勢，以及估算高鐵便捷和高鐵可達性帶來衍生旅客出行需求。政府和港鐵不把這些更具參考作用的數據羅列，並據此計算高鐵通車後的客運量，而只是說乃保守的數字，卻說不清楚怎樣的保守、為甚麼保守，顯然政府的施政原則已偏離過往重視科學與專業的原則。
或許故意把載客估算降低，只是為了與港鐵的協議。在估算運載量達不到的情況下，政府按協議是要包底的，於是估算運載量愈低，包底的機會愈小。而超出運載量的收入是政府與港鐵分成，對政府來說是額外收入，多少不重要，重要是不要有包底支出的政治風險。從財務上看，這是合理的安排，但本來鐵路載運量估算有一定的科學根據，現在卻變成由政府隨意修改，以適應管理需要，不再尊重科學與專業，這是典型的官僚做法。為方便任意決定，這個政府變得任性了。