九鐵自○七年將鐵路營運資產及鐵路網絡經營權租予港鐵，每年會收到港鐵七億五千萬元的定額款項，若港鐵營運鐵路網及其他鐵路相關業務收入逾廿五億元，便須額外再給予九鐵一筆非定額款項。
九鐵年報顯示，去年共收到十九億三千三百萬元非定額款項，較一六年的十七億八千七百萬元上升百分之八。
淨虧損較16年大減36％
另外，九鐵去年會計淨虧損為一億七千七百萬元，較一六年錄得的二億八千萬元虧損大減三成六。九鐵主席劉怡翔在年報中表示，雖然九鐵年度帳目仍出現會計虧損，但當中大部分為資產的非現金折舊開支所致。他預期數年內，九鐵將進一步改善財務業績及償還餘下之債項，並於不久將來實現長期會計溢利。