蓮塘口岸三巴士線僅一條全日服務
新出入境管制站蓮塘口岸預計今年年底完工，運輸署建議開辦三條新專營巴士路線及一條專線小巴，巴士線分別往返上水、大圍及屯門，途經新興建的龍山隧道及長山隧道，另在口岸區提供約四百多個公眾泊車位。立法會議員認為僅得一條巴士線提供全日服務，泊車位數目亦不足，難以應付人流，批評署方做法保守，宜及早妥善預備。
根據諮詢文件，全日服務的巴士由管制站往返上水鐵路站途經粉嶺站，預計每十二分鐘一班車。另兩條巴士線只於管制站開通初期於星期六、日及公眾假期營運，分別往返大圍鐵路站，途經大埔及往返屯門鐵路站，途經元朗鐵路站，兩線同樣預計每三十分鐘一班車，運輸署將於今年中開始為新專營巴士路線招標營辦，以便獲選者有足夠時間開展籌備工作。
倡泊車位增至千個
立法會議員兼北區區議員劉國勳認為，蓮塘口岸連接的深圳東及惠州市均是港人投資熱點，料人車流皆多，建議三條巴士線改為全日服務，泊車位應增加至千個。目前小巴59K號線往來上水鐵路站及蓮麻坑，運輸署建議新增一條短途特別服務往返管制站及上水鐵路站，預計每十二分鐘一班車。公共小型巴士總商會主席凌志強贊成，倡增四至五輛車行走新的短途線。
過境程序近似羅湖
新管制站蓮塘口岸為本港首個設有「人車直達」設施的道路口岸，市民可以利用公共交通服務或私家車直達新管制站。港方旅檢大樓設有四層，頂層至底層分別為港方入境層、港方出境層、私家車停車場及公共運輸交匯處，市民將通過跨境橋，橫跨深圳河抵達深圳旅檢大樓，程序與於羅湖口岸出境相若。
另外，新管制站的相關工程尚在進行中，土木工程拓展署現正建造龍山隧道及長山隧道，以及相關連接路以連接新管制站和粉嶺公路，駕駛人士可直接利用粉嶺公路經兩條行車隧道往來管制站，行車時間將大為縮短，預計新管制站有助減輕其他陸路邊境管制站的壓力。