有中學生組織在網上成立港獨關注組，揚言將通過各種方式在校內宣揚港獨理念，會參考前年學民思潮成立中學政改關注組的經驗，要在全港十八區逐步建立港獨關注組，事態發展引起教育界高度關注。主流民意認為教育局要認真重視並採取有效措施，防止校園變成「播獨」的溫床。
教育局不敢怠慢，所謂茲事體大，更適逢立法會換屆選舉，本土派崛起，確認書事件令港獨議題廣受社會注目，且有港獨政黨高調表示會鼓勵大專院校及中學成立港獨組織，於是局長吳克儉頻密會晤教育界團體研擬對策，又鼓勵各團體公開表態，反對港獨思潮荼毒莘莘學子。
值得注意的是，吳局長北上會晤國務院教育部官員後表示，教育界已經有共識，可以在《基本法》大前提下，容許校園內討論港獨這個議題，不過，校園內不應出現主張及推動港獨的行為。吳局長又表明局方毋須額外發出指引。
教育局及教育界吸取四年前「反對國民教育」運動的經驗教訓，明白在社會上有港獨思潮蔓延，而中學生恰處青少年反叛期，好奇心上升且身處網絡世代，他們容易接觸花花世界，正如中學校長會主席指出，「任何反教育的壓制式管教，只會適得其反，要讓學生有足夠空間學習多角度思考」。
主流民意不認同港獨是一回事，如何引導學生通過理性討論，明白港獨行不通，不單違反《基本法》，更會令香港萬劫不復，則是另一回要剛柔並濟處理的事。