國民黨兵敗如山倒，總統與立法院雙雙慘輸，輸掉了政權，輸掉了信心，但不能輸掉志氣。國民黨終於做了敗選檢討，中常會的檢討結論是「被自己打敗了」。
檢討列出敗選五大原因，首要是施政未獲認同，原來馬英九誇誇其談的各種數字政績百姓並無感受，施政不理想，民心背離，選票投向了在野黨，不是對民進黨的喜好而是對國民黨的失望。
檢討之首要指向了馬英九的八年施政是最大敗筆，黨內如此批判，馬英九情何以堪，台灣媒體甚至稱馬英九是「頭號戰犯」。
檢討敗選的其他原因是兩岸論述無法凸顯兩黨品牌的差異，這八年來，民進黨漸漸向中間靠攏，而國民黨則漸向綠營靠攏。尤其是對前景論述都抄襲民進黨，如引用民進黨所說「以台灣為主、對人民有利，台灣前途由二千三百萬人來決定，中華民國是主權獨立國家」等等，的確讓人民有所困惑，無法區分兩黨政策的差異。此外還有黨內矛盾不團結，缺乏長期培養人才，馬英九當了七年的黨主席，在黨內沒有積極的培養接班人才，讓國民黨人才及接班斷層，面對黨內矛盾因堅持定見而沒有化解，讓黨內的矛盾破壞了團結。
國民黨敗選檢討的幾大因素，均脫離不了馬英九。馬英九的清廉執政品牌也未獲得讚賞，水清則無魚，周遭人士離心離德。
國民黨即將下台，馬英九的噩夢才開始，其過去的從政之路，從台北市長開始必受民進黨嚴苛的檢驗，現已露出端倪，柯文哲要追究的圖利他人罪以及瀆職罪，馬英九卸任後必官非不斷，甚而遭到判罪。不過蔡英文現高舉和解的旗幟，有可能特赦馬英九達致藍綠和解目標，蔡的威望空前，可鞏固民進黨執政基礎。