「習馬會」已過，效應不致快速消逝，更何況馬英九念茲在茲的是希望為其執政獲得歷史定位，也希望因此拉抬國民黨的選情，因之馬英九抓住「習馬會」的議題召開記者會，又投書美國最大的報章，對「習馬會」細說從頭及感懷。
「習馬會」在一片讚嘆聲中落幕，但台灣也有輿論抨擊馬英九在與習近平見面的公開陳述中，為何在提到「九二共識」時，沒有延伸強調國民黨一貫的立場即是「一中各表」。後來馬英九強調在閉門會議的時候曾提及，但台灣尤其是綠營有所不滿，批評馬英九為何不敢大膽說出「各自表述」的空間，不要讓中華民國消逝於一個中國的原則下。
馬英九是一個追求自我完美的人，對此批評十分在意，他以總統身份透過全美發行量最高報章《今日美國》，發表「當我稱呼習先生」專文，他表示，台灣絕未為「習馬會」在民主或自由方面作出任何讓步。
馬英九又強調在兩岸關係上，要為未來雙方領導人的互動，建立對等尊嚴的模式，在國際上，與習共同傳遞強烈的和平訊息，此符合台灣、中國大陸與美國的最大利益。
固然，習馬會是一九四五年國共內戰爆發前夕蔣介石與毛澤東會談後，七十年來兩岸領導人突破性的會面，但現國共勢力消長形勢丕變下，這場「習馬會」在部分台灣人眼中，認為中國強大讓台灣底氣不足，馬英九是委曲中求得分。馬英九在「習馬會」上提出了諸多要求，稱綠營對大陸部署導彈不滿意，而未表達台灣人之憂心，台灣民眾對馬不敢正面表述事實更是多所批評。其實跨出「習馬會」這步殊不容易，雙方只有努力呵護得來不易的和平，才能為雙贏目標鋪路。