聲稱以消除歧視為己任的平等機會委員會,成立至今雖然只有短短十九年,惟已先後出現過七任主席,無人在任超過五年。當中除了周一嶽任內劣迹斑斑,其他多任主席都曾爆出醜聞或爭議。其中第二任主席胡紅玉被指用人唯親,決定狀告教育署歧視男生亦引起極大爭議。接任的王見秋又先後被揭亂炒人及收受富商機票,上任不足一年便被迫下台。第五任的鄧爾邦更被揭大花筒兼管理混亂,遭審計署及立法會狠批。學者直斥平機會等港英末期成立的法定監察機構,未有發揮應有職責,成效存疑,反令社會矛盾加劇。
現任行政會議成員、在回歸前有份於前立法局推動首條歧視條例立法的胡紅玉,在九九年出任平機會主席。她任內被指干犯「六宗罪」,包括用人唯親,以內部推薦形式大幅增加職位,還有排除異己解僱逾十位職員,部分其後更反告平機會歧視。○一年,她決定就中一派位制度控告教育署性別歧視,在教育界及社會惹起極大爭議。胡紅玉在任四年即不獲政府續約,由前上訴庭法官王見秋於○三年接任。
王見秋上任後不久,決定解僱仍未履新的候任行動科總監余仲賢,表面理由雖為余曾發表支持種族歧視立法的言論,超出平機會職能範圍,但事件其後被解讀為王與前任主席胡紅玉的權力鬥爭。王見秋及後更被揭在任職法官期間,收取富商「大劉」劉鑾雄所贈機票,但未有向司法機構申報利益。結果王上任不足一年即被迫下台。
○五年由私隱專員轉任平機會主席的鄧爾邦,在任五年期間平機會與他本人均醜聞不絕,包括在○九年被審計署揭發行政混亂及亂花公帑,例如計劃豪花五十萬元舉辦研討會,在外界質疑後竟可縮減至只需三十二萬元埋單。派街坊用的環保袋、釘書機等紀念品有成千上萬存貨,平機會卻繼續採購新貨。還有不當處理資產,進行採購時未有按規定取得最少三個報價等。
鄧爾邦又被踢爆,在○七年與一名高層飛往瑞典作五日考察時乘坐商務客位,惟邀請機構只支付了一張經濟客位機票,平機會需另花二萬三千七百多元機票開支。他在○五年與代表團出訪北京時,四日豪花十六萬元,包括他一人入住每晚租金達二千八百多元的大使套房,其中一晚的膳食費超過一萬五千元,但賓客身份卻不明。
此外,平機會於○七至○八年及○八至○九年的整體保費開支,每年只需廿多萬元,惟單是鄧爾邦一人的人壽保險保費,已分別佔約二萬四千元及一萬三千元,保額高達他的三年薪金。立法會政府帳目委員會舉行多場公開聆訊後,直斥鄧爾邦領導能力不濟,未能妥善履行職務,令平機會的企業管治,未能達到法定機構的應有水平,對此表示「極度遺憾」,認為鄧「難辭其咎」。
城大專業進修學院學術統籌宋立功指出,平機會主席不斷替換,反映「內部管理好多問題」。他又質疑平機會及私隱專員公署等港英末期成立的法定監察機構,多年來未有發揮應有職責,反令社會矛盾加劇,「好似同性婚姻問題,平機會立場左搖右擺,不但無法令社會達致真正公平,反而激化咗唔同立場人士衝突。」