粵港澳要發展成為世界一流的大灣區經濟，首先就要避免城市之間的無序競爭，以防互削實力，這才有利提升整體的對外競爭優勢。但要做到這一點，並不容易，有很多問題需要仔細研究、磋商和協調的。
東京灣區的成功，關鍵是日本政府能根據各城市的基礎和特色，統籌和引導產業定位，形成合理的分工協作體系，發揮了整體優勢。例如，區內有東京港、橫濱港、橫須賀港、川崎港、千葉港、木更津港等六個世界級港口，但有明顯分工，不僅沒形成惡意競爭，且大大提升了整個灣區的物流效益。
中央近年推動粵港澳緊密合作與融合發展，支持香港作為國際金融、貿易、航運、物流、高增值服務中心，並支持澳門作為世界旅遊休閒中心的地位，同時希望建立港深、港穗、珠澳的創新合作機制。可以看出，國家對粵港澳未來的分工合作，其實已有初步的構思。
目前，前海深港現代服務業合作區、橫琴新區和南沙新區，均獲國家批准，粵港澳自貿區也在推進之中，享有先行先試的優勢。發展粵港澳大灣區經濟，基礎和條件都已具備，但最關鍵的還是兩地制度如何磨合的問題。
須知道，粵港澳畢竟屬於不同的行政區域，香港和澳門是特別行政區，與內地管理制度不一樣。香港一向奉行自由港政策，經濟傾向讓市場主導，政府盡量不干預；內地則不同，雖云中央政府現也開始提出「簡政放權」，但畢竟政府仍擔當着主導角色。將來粵港澳如何在不同體制下分工，此課題已頗複雜。