製作冰皮月餅並非易事，要有良好設備才能做出無菌衞生的冰皮月餅。根據食環署提供冰皮月餅製造指引，製造冰皮月餅的店舖，須在設計及設施方面符合食環署訂定的發牌及持牌條件，亦要有一套清潔及消毒計劃，以監察和管理所有可能會影響冰皮月餅食用安全的設備、用具和冷藏裝置，而售賣冰皮月餅的認可零售店舖設有適當及足夠的冷藏設備。
本港大型連鎖餅店負責人表示，冰皮月餅未如傳統月餅經過有殺菌效果的高溫烘焙，製作時要很謹慎，確保衞生。他指，該公司生產冰皮月餅時會配合食環署指引，在無菌工作間生產及密封包裝；而顧客購買後亦會附以乾冰確保低溫，避免孳生細菌。他稱，在住家廚房製作冰皮月餅，一旦沾有霉菌等細菌，在出售過程中又沒有密封包裝，可能會令細菌加速繁殖，影響健康。
另有本港麵包店負責人指，製作冰皮月餅並不容易，因需要大型冷凍櫃，製作工場亦要確保徹底清潔及消毒，「真係要做足準備先可以出售，所以好多細型麵包店都唔會賣，寧願整傳統月餅。」