陸委會副主委張顯耀的去職事件，出現雙方交火場面。張顯耀聲淚俱下真情告白，吐露處理一切兩岸事宜均是依照長官的意旨辦事，陸委會又出手，指控張顯耀案件涉及國家安全，據傳是向中方談判代表洩露貨貿協議的談判底線，涉及違反國安，重之可以是叛亂罪。
兩方前後的聲明及告白呈完全相反的發展情勢，但對象都是針對北京當局，引起了台灣內部的探討，北京是敵人還是朋友，仍是叛亂團體還是兩岸同為「一中」？
張顯耀事件被馬英九政府營造成形同「通敵叛國」的案件，無形中讓兩岸敵對的情勢升高，今後與北京協商談判，是否又回到兩岸冷戰時期的「與共談判」還以「匪」的心態防禦之，將會影響兩岸的互信。
馬英九數度表達希望於年底北京舉行的ＡＰＥＣ會議上，能成就「習馬會」，但以對張顯耀事件的處理方式而言，習馬將是無緣相見，看來「習馬會」的機遇已逝。
張顯耀涉及國安事件，茲事體大，但陸委會原先幫其想好「照顧母親」的藉口，又要幫其安排企業董事長一職，若張真有「通敵叛國」之嫌，此舉又如何向民眾交代？馬英九政府處理事件不夠周延，手法粗糙，引起了極壞的社會回響。
近期馬英九接見工商界代表時強調︰「不可輕忽中國經濟實力與崛起，不必天使化，也不必妖魔化中國。」馬政府也強力批判國會不能順利通過服貿協議，且暗示「不排除與中國大陸協商政治議題」，這應是馬英九政府對大陸展現的善意，現卻背道而馳。
此案件已進入調查的程序，對陸委會同仁無疑起了警示效應，對兩岸協商將戒慎戒懼，兩岸敵我之情暗濤洶湧，正需馬英九政府盡快釐清兩岸究竟是敵是友，或是亦敵亦友。