屯門公路轉乘站啟用後，多條巴士線均設有轉乘優惠。不過，李先生發現，轉乘站的轉乘優惠並非最「優惠」乘搭方法。李指其中由機場往屯門石排頭路，如先乘搭龍運E33線，車費為十三元九角，於屯門公路轉車站轉乘960線，車費為十元六角，全程需費二十四元五角。但於屯門市廣場轉乘相同路線，第二程車費僅四元八角，全程僅十八元七角。李不滿相同路線巴士，但轉乘站不同，總車費相差竟逾三成。
九巴發言人表示，乘客於屯門公路轉車站轉乘960線會較快捷及直接，就李先生的個案，發言人建議可先乘搭E33線於屯門公路轉乘站乘搭66M線，車費合共為十七元九角。此外，市民往目的地前，亦可參考九巴網頁內「路線與服務」一欄，了解個別路線的收費及服務詳情、轉乘組合等選擇資料。
「點解去相同地方，都有唔同車費？九巴始終解釋唔到！」李先生斥九巴轉乘優惠混亂，應研究更加簡單易名的轉乘方法，否則只予人巧立名目多收車資感覺。