抑制胃酸的藥物可分為組織胺受體阻斷劑和質子泵抑制劑，可紓緩疼痛、胃灼熱、消化不良等徵狀。由於藥物可掩蓋胃癌病變所引起的徵狀，所以服藥前應徵詢醫生意見，排除出現惡性腫瘤的可能性，以免延誤診治。
當食物將到達胃部時，黏膜細胞會分泌可刺激胃酸分泌的物質，其中一種是組織胺。使用組織胺受體阻斷劑，如法莫替丁及雷尼替丁等，可抑制胃酸分泌，減低胃酸對胃黏膜的傷害，有助促進胃及十二指腸潰瘍愈合。藥物的常見副作用包括頭痛、眩暈、疲倦、腹瀉、皮疹等。口服藥物通常每日服一至兩次，服藥時間毋須配合用餐。藥物可通過胎盤進入胎兒及從乳汁中排出，孕婦及哺乳中的婦女必須徵詢醫生意見，衡量風險才可服藥。
另一種是質子泵抑制劑，如埃索他拉唑、蘭索拉唑和泮托拉唑等，此類有抑制H+/K+-ATPase酶的作用，直接阻止胃酸的產生，作用較組織胺受體阻斷劑強。此類藥物可用於預防及治療消化性潰瘍，有促進胃及十二指腸潰瘍愈合的作用。常見副作用有頭痛、腹痛、惡心、嘔吐、腹瀉、便秘、脹氣等。質子泵抑制劑與另外兩種抗生素聯合使用一星期，可殺滅導致消化性潰瘍的幽門螺旋桿菌。
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