馬英九一直被獨派質疑他向中國妥協，最後台灣將成為中國的特別行政區，馬總統淪為「馬區長」，這樣的評論，讓國民黨政府忿忿不平。這次吳伯雄向胡錦濤提出了「一國兩區」，承諾台灣是「台灣地區」，因之也讓在野黨「尊稱」的「馬區長」有了正當性。
記得二○○八年馬英九甫就職，前往澎湖視察時，當地抗議民眾高舉海報，上面寫着︰「歡迎中國地方首長馬英九蒞臨」並喊着「馬區長好！」馬英九的臉都綠了，現國民黨自己提出「一國兩區」，綠營人士再喊「馬區長」也就更高亢了。
話說「馬區長」的由來乃自二○○八年馬英九上任後，接受墨西哥媒體的訪問，談到兩岸關係是一種特別的關係，不是「國與國」的關係，而是「兩個地區」的概念。這個講話即遭到民進黨的強烈抨擊，認為馬英九向中共投降，自己降格為中國的一區，「馬總統」就被喚成了「馬區長」。今吳伯雄代表馬英九赴對岸，拋出了「一國兩區」的說法，其實是承繼了馬英九的一貫思維，兩岸是兩個地區的概念。
雖然「一國兩區」在台灣引起了朝野極大的爭議，但這表現了馬英九的意志。據國民黨高層稱，吳伯雄在會見胡錦濤時，手持洋洋灑灑十二張講稿照本宣讀，實是受人之託，忠人之事，這應是馬英九的文稿。
剖析馬英九的策略應是希望「吳胡會」能營造「對岸贏得一中的說法，馬贏得對等的兩區」，也就是不管地域大小，經濟實力的區分，兩岸就是對等的兩區，這其中有妥協也有突圍，北京若承認了「一中兩區」，依此理論，聯合國也應有兩席中國的席位，台灣就可開大門走大路，正式登上國際舞台，馬區長不是做小，而是要做大了台灣！