協調香港紅花嶺及深圳梧桐山國家森林公園
保育伶仃洋水域的中華白海豚
推進水環境質素管理和水污染控制，包括實施珠江口水環境整治綜合計劃
加強區域大氣污染物減排控制合作，如優化區域大氣污染監測網絡
推動企業清潔生產
促進環保產業發展，探討成立大珠三角環保產業合作委員會的可行性
支持再生能源發展，三地合作評估區域新能源發展的潛力、推動使用低碳車輛等
加強支援跨境學童的交通服務
研究港澳在粵居住養老者福利保障制度對接的可行性
完善食品安全訊息交流，包括推進對供港澳食品的企業引入危害分析和臨界控制點體系的研究
推進落馬洲河套地區、深圳前海和廣州南沙新區
開展快速軌道交通走廊
優化區內城市交通結構，如促進三地的交通卡互通互用
研究延長口岸通關時間，必要時可考慮陸續增加24小時通關的口岸