陳水扁國務機要費弊案大逆轉，在一審因涉貪被判無期徒刑、二審被判刑二十年的陳水扁，貪污部分改判無罪，僅因偽造犒賞清冊及洗錢罪判刑兩年八個月。陳水扁聽判後露出微笑，但司法界和民眾對刑度大幅落差引起震撼。
扁家弊案，包括國務機要費、南港展館案、龍潭購地、海外和人事案等。其中龍潭及人事兩案，去年底依貪污罪判決定讞，扁珍夫婦均被判刑十七年六個月，其他三案發回更審。國務機要費案改判就是更一審的結果，理由是合議庭認定扁將國務機要費用於二十一項機密外交與犒賞饋贈支出，多過檢方起訴他所貪污數額，即其領取的國務機要費全部支用。
法理上更判似乎有理，但所犒賞饋贈之人是扁家所謀私的對象，實仍是貪污。此時更審扁案，意義不在扁家，而在馬英九和蔡英文的雙英大戰。不管如何，主辦此案的特偵組上訴。
表面上，陳水扁國務機要費案獲更判無罪，綠營扁系以「公道」讚頌結果，但打扁的藍營卻痛批「公道」無法伸張，質疑承審法官是挺扁暗樁。事實上，只要這場世紀弊案佔據輿論中心，民進黨就要吃虧，畢竟扁家的貪婪不但藍營痛恨，綠營也恨之入骨，當年紅衫軍領軍的便是民進黨前主席施明德；馬英九也藉勢大勝二百多萬票，幫國民黨拿回政權。
因此，蔡英文拒絕評論阿扁國務機要費案改判無罪。蔡英文當初接民進黨主席一職時對扁不願切割，如今她不管怎麼說都有護短之嫌；反觀馬英九，不管改判是否合理，只是強調尊重司法獨立，只會得分不會失分。