公務員內部有一套紀律處分機制，如文職及紀律部隊職系公務員干犯輕微不當行為，例如遲到、違反性質輕微的政府規例等，其隸屬部門完成內部調查後，毋須進行正式紀律聆訊，便可向當事人發出口頭或書面警告。
對於屢犯輕微不當行為或干犯較嚴重的不當行為，例如擅離職守、濫用職權、蓄意罔顧正式指令等，又或被法院裁定干犯刑事罪行的公務員，有關部分則會採取正式紀律行動，經初步調查後若有足夠理據，會將個案轉介公務員事務局轄下公務員紀律秘書處按《公務人員（管理）命令》處理。紀律處分包括譴責、嚴厲譴責、降級、迫令退休及革職，亦可根據不當行為或刑事罪行嚴重性，同時施加減薪、暫停或延期增薪、罰款等懲罰。