關愛基金已經變質，成為政府與民間、政府與財團、政府與社福機構、政府與政黨之間的矛盾。
第一，政府打算透過關愛基金向新來港人士派發六千元，有人批評此舉是公然歧視新移民；而政府只以基金去資助清貧中、小學生參加遊學團，但對於更佔大部分應該受到關愛基金支援的N無人士，政府還未交代支援細節，因此被人批評是「大細超」，緩急輕重不分。
第二，財團不支持關愛基金。關愛基金自從去年施政報告提出後大半年過去，在完全沒有制訂任何服務及援助指標的大前提下，政府便煞有介事地向坊間財團募捐五十億，財團有感這是政府「霸王硬上弓」，自然罵聲不斷。現階段財團抱持靜觀其變的態度，關愛基金款項還未達標實在是意料中事。
第三，關愛基金與本地社福團體構成競爭。關愛基金的性質等同公益金、東華三院等歷史悠久的本地社福機構，也是依賴財團捐款，向坊間人士提供服務。然而，兩者的服務對象多有重複，不僅是資源錯配；更何況，關愛基金由政府設立，理論上由政府下達募款指示，要比社福機構外出籌款更加強而有力，更易達標。
第四，關愛基金淪為派發政治酬勞的小金庫。政府以關愛基金來應對政治問題，政府有甚麼政治上的頭暈身熱，就都會用關愛基金向各方疏通。反對派認為，關愛基金是政府對反對派虛與委蛇，以換取支持政府施政的目的。難怪，政黨攻擊關愛基金是政府用來應付輿論、敷衍民意的「政治機器」。