規劃中的沙中線共設十個站，目前工程造價估算較○七年約三百八十二億元估算增加五成七，由於鐵路詳細設計現時只做了一半，當局預計二○一二年初會有更準確的造價估算，立法會議員王國興擔心兩年後造價會更高，「擔心仲高過高鐵，超過七百億！」
議員鄭家富及李鳳英則對沙中線中的大圍至紅磡段延遲三年至二○一八年才通車，紅磡至金鐘段更要遲至二○二○年，擔心這十年間造價亦進一步推高。運輸及房屋局副局長邱誠武回應指，造價上升是由於建築物料上漲，不排除會再上調，但他強調鐵路帶來五十年的社會效益將以千億元計，故認為興建沙中線是物有所值，而造價與將來票價的釐定無直接關係。