國民黨重新執政以來一直備受抨擊，馬英九「黨政分際」之理念，讓國民黨最終以「以黨輔政」為定位，淡出過去的政策制訂機構角色。國民黨在馬英九政府中雖不能說聊備一格，但轉型為選舉機器功能，權威性漸減。國民黨選出的公職人員並沒有獲得黨太大的加持，黨籍立委在黨的勢力漸趨薄弱之際，只有強化個人影響力，故立委乃以民意為圭臬，以民意重於黨意，不願充分配合黨的政策。如美牛協議在立法院無法通過，正顯示立委們的顧慮，他們不惜違背黨意，封殺美牛協議而修法。
立法院一直是馬英九執政後的夢魘。馬英九一直揮不動黨籍立委，無法令他們為黨政策護航；黨籍立委為了連任，只有兄弟登山，各自努力，因為黨的資源薄弱，黨在社會的威信蕩然，只能自力救濟。立法院長王金平是立法院內藍綠共同擁戴的院長，他的圓融令他沒有敵人，對藍綠立委表現均予以尊重，但他曾比喻自己於孤峰頂上，在院長超然的立場上，對黨籍立委的叛變亦莫可奈何。
馬英九政府一直與立法院缺乏溝通，立法院的衙門一直是令馬英九頭痛、也是他難以掌握之處。
上任不久的國民黨秘書長金溥聰前往立法院拜會王金平，盼能消除當年在競選黨主席時馬、王二人之爭而結下的恩怨，共同合作，為馬英九政府抬轎。金溥聰說他上任黨秘書長以來忙於競選，遲來立法院拜會。對於黨內的問題，他急於將傷口彌合，先縫合起來，裏面到底是長肉還是長膿，等以後再說。
肉腐而蛆生，以此來形容國民黨頗貼切，但難免刻薄。國民黨難道是窮斯濫矣？有如此雄厚的底蘊仍落得今日的下場，導致全民共批的現象，國民黨的境遇難道真的是肉腐而蛆生？