吳尊育有一子一女,湊夠一個「好」字,大女吳欣怡十月便4歲,他暱稱女兒做NeiNei。NeiNei樣子超萌,更與吳尊一樣10月10日生日。於2013年10月1日,吳尊首度在官網發表聲明指自己已在2009年結婚及透露育有一女,及後亦有出書《決定勇敢》披露與太太的一段情。
吳尊一向重視家人,亦是一位好爸爸,今年她與囡囡參加了內地親子節目《爸爸回來了》,大晒父女溫馨互動,當中兩人拍攝了一輯可愛的婚紗照,又有他替女兒洗澡和下廚的溫馨片段。