目前養殖鰻魚的來源仍是野生鰻魚苗，魚苗數量因為環境破壞和過度捕獲而銳減，今年春季情況相信是史上最差。有台灣專家表示，今年降海的種鰻大減，無法形成有效的產卵群，產生崩潰效應，擔憂日本鰻十年內走向滅絕。除了日本鰻，作為替代品的歐洲鰻及美洲鰻也有減產危機。日本鰻與美洲鰻同被國際自然保護聯盟組織列為瀕危，歐洲鰻更列為極危。