陳鎮慧因配合偵辦，一審時獲特偵組代為向法官求情，公訴檢察官亦以陳鎮慧悔過立功的表現，請求免刑判決。但合議庭認定陳鎮慧要與扁珍等人，共同負起遭連帶追繳貪污所得的責任。另外，由於她被控利用不實犒賞清冊詐領國務費，二審認為法律有關行使偽造文書罪部分並沒有免刑規定，判她入獄七個月，另考慮她對扁案有突破貢獻，因此緩刑兩年。
扁親信馬永成大幅減刑
另外，曾是扁親信的前總統府副秘書長馬永成、前總統府辦公室主任林德訓，則同獲減刑。其中，馬永成從原判二十年大幅減至十一年半，幾乎打了五折。不過，外界認為於府內掌權不高的林德訓，改判後仍然達十二年半，反而比馬永成多一年。