08年11月12日 扁首度遭羈押

08年12月12日 檢方正式就多宗弊案提出起訴

08年12月13日 台北地方法院裁定毋須交保釋放；法官周占春惹爭議，特偵組向高等法院提上訴

08年12月18日 高院把羈押案發回北院再審，再次裁定無保釋放

08年12月26日 扁家弊案全併入國務機要費案的合議庭處理，法官蔡守訓接手

08年12月30日 蔡守訓裁定扁再度羈押

09年09月11日 扁家弊案一審宣判，12名被告自行或由檢方上訴

09年09月24日 二審程序啟動，扁家弊案移審高院，法官抽籤並為扁開羈押庭